Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODH2Q9UF12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms