Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3KQ9UBQ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3KQ9UBQ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms