Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD2Q9UBJ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD2Q9UBJ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms