Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf48Q9UBA6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms