Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMC3IPQ9P2W1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms