Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL42Q9P2K6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL42Q9P2K6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms