Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC50.77■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC50.76■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC50.74■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC50.74■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC50.74■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC50.74■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC50.74■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.73■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC50.72■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC50.72■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC50.71■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC50.71■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC50.71■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.71■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC50.7■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC50.7■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC50.7■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
CCDC180Q9P1Z9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC50.69■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC50.69■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC50.68■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC50.67■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC50.67■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC50.67■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC50.66■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC50.64■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC50.64■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC50.63■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.63■■■■■ 5.7
CCDC180Q9P1Z9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC50.62■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.61■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC50.6■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC50.6■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC50.59■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC50.58■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC50.58■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC50.58■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC50.58■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC50.56■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.69
CCDC180Q9P1Z9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC50.56■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.54■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC50.54■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC50.54■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC50.53■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC50.52■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.51■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC50.51■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC50.51■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC50.51■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC50.51■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC50.51■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC50.51■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC50.51■■■■■ 5.68
CCDC180Q9P1Z9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC50.5■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC50.5■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC50.49■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC50.49■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC50.48■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC50.48■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC50.46■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC50.45■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.44■■■■■ 5.67
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC50.44■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC50.44■■■■■ 5.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms