Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SENP1Q9P0U3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP1Q9P0U3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms