Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD3Q9P035 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms