Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTEL1Q9NZ71 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTEL1Q9NZ71 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1Q9NZ71 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms