Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USE1Q9NZ43 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USE1Q9NZ43 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USE1Q9NZ43 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 769.1 ms