Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRN3Q9NYV6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRN3Q9NYV6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms