Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RLIMQ9NVW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RLIMQ9NVW2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLIMQ9NVW2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms