Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF13Q9NV06 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCAF13Q9NV06 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms