Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS45Q9NRW7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS45Q9NRW7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms