Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD11-211ENST00000585265 670 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD11-205ENST00000493026 2387 ntTSL 212.22□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBFOX2-208ENST00000416721 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBFOX2-210ENST00000449924 1935 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBFOX2-202ENST00000359369 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.652e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBFOX2-204ENST00000397305 759 ntTSL 510.42□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 SLC50A1-207ENST00000479579 475 ntTSL 38.85□□□□□ -0.991e-11■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -12e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBFOX2-213ENST00000491982 1004 ntTSL 28.75□□□□□ -1.012e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBFOX2-206ENST00000408983 663 ntTSL 38.5□□□□□ -1.052e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.092e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 TFRC-205ENST00000426789 354 ntTSL 32.05□□□□□ -2.082e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX2-203ENST00000466174 1717 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.132e-7■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-7■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX2-201ENST00000301522 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-7■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 HOOK2-213ENST00000589765 108 ntTSL 59.79□□□□□ -0.842e-7■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.534e-24■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS17-210ENST00000561440 1922 ntTSL 216.77■□□□□ 0.284e-24■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS17-205ENST00000560229 776 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.014e-24■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS17-206ENST00000560612 1877 ntTSL 27.91□□□□□ -1.144e-24■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.154e-24■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS17-208ENST00000561068 522 ntTSL 35.18□□□□□ -1.584e-24■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS17-202ENST00000558397 583 ntTSL 34.73□□□□□ -1.654e-24■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS17-207ENST00000560639 932 ntTSL 54.62□□□□□ -1.674e-24■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.096e-9■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 DDX5-218ENST00000581693 2156 ntTSL 511.72□□□□□ -0.536e-9■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 DDX5-203ENST00000540698 2225 ntTSL 511.42□□□□□ -0.586e-9■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.756e-9■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 DDX5-215ENST00000581230 3558 ntTSL 27.18□□□□□ -1.266e-9■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-212ENST00000472254 934 ntTSL 212.77□□□□□ -0.375e-7■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.593e-9■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.853e-9■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 28.13□□□□□ -1.113e-9■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 57.62□□□□□ -1.193e-9■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.124e-6■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-201ENST00000267115 2836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.874e-6■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.932e-9■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.379e-11■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.259e-11■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 513.06□□□□□ -0.329e-11■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MPP1-213ENST00000482757 989 ntTSL 29.48□□□□□ -0.899e-11■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MPP1-216ENST00000491955 2378 ntTSL 26.06□□□□□ -1.449e-11■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.478e-8■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.38e-8■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.158e-8■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.068e-8■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.088e-8■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.128e-8■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.158e-8■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 55.84□□□□□ -1.488e-8■■□□□ 14.4
APOBEC3CQ9NRW3 APOC1-204ENST00000589078 213 ntTSL 210.49□□□□□ -0.736e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB5-202ENST00000359944 1054 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.172e-10■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB5-203ENST00000468210 824 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-10■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-10■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB5-201ENST00000259037 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.532e-10■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB5-214ENST00000493866 4046 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-10■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB5-204ENST00000471112 684 ntTSL 36.3□□□□□ -1.42e-10■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB5-207ENST00000476587 635 ntTSL 23.48□□□□□ -1.852e-10■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB5-206ENST00000473500 689 ntTSL 33.3□□□□□ -1.882e-10■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL2-205ENST00000480286 661 ntTSL 215.69■□□□□ 0.15e-7■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.583e-29■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-29■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 221.99■■□□□ 1.113e-8■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.562e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-216ENST00000550184 1564 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-206ENST00000547408 683 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.772e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.012e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.152e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.392e-9■■□□□ 14.3
APOBEC3CQ9NRW3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.933e-6■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.468e-14■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPH3-210ENST00000490442 1521 ntTSL 215.28■□□□□ 0.048e-14■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPH3-206ENST00000478698 1507 ntTSL 215.28■□□□□ 0.048e-14■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.198e-14■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPH3-211ENST00000491200 2308 ntTSL 1 (best)13.49□□□□□ -0.258e-14■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPH3-208ENST00000481819 2704 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.488e-14■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 SUMO2-201ENST00000314523 809 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.742e-7■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPH3-205ENST00000469172 3356 ntTSL 210.25□□□□□ -0.778e-14■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.211e-7■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-7■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.513e-7■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -03e-7■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB3-210ENST00000618159 562 ntTSL 210.25□□□□□ -0.773e-10■■□□□ 14.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-211ENST00000490633 401 ntTSL 315.47■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.395e-7■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.135e-7■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)18.72■□□□□ 0.596e-9■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-214ENST00000583816 860 ntTSL 315.97■□□□□ 0.158e-7■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.866e-9■■□□□ 14.1
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