Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO6Q9NRD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO6Q9NRD1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO6Q9NRD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms