Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLE4Q9NR33 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLE4Q9NR33 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms