Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BIN3Q9NQY0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms