Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN4Q9NQP4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PFDN4Q9NQP4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms