Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD7Q9NPI1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
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