Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB9Q9NP78 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB9Q9NP78 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms