Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP4Q9H3Q1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP4Q9H3Q1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC42EP4Q9H3Q1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP4Q9H3Q1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP4Q9H3Q1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP4Q9H3Q1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP4Q9H3Q1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP4Q9H3Q1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP4Q9H3Q1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP4Q9H3Q1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms