Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDCL3Q9H2J4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDCL3Q9H2J4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms