Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC90BQ9GZT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC90BQ9GZT6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms