Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR3CQ9C0K3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR3CQ9C0K3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTR3CQ9C0K3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms