Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM4Q9C037 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM4Q9C037 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1570.8 ms