Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SALL3Q9BXA9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SALL3Q9BXA9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms