Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM106CQ9BVX2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM106CQ9BVX2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM106CQ9BVX2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms