Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFHD1Q9BUP0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms