Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD6Q9BRQ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD6Q9BRQ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD6Q9BRQ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD6Q9BRQ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD6Q9BRQ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD6Q9BRQ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD6Q9BRQ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD6Q9BRQ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD6Q9BRQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms