Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA1CQ9BQE3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms