Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ECSITQ9BQ95 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECSITQ9BQ95 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECSITQ9BQ95 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ECSITQ9BQ95 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECSITQ9BQ95 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms