Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP9Q99956 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP9Q99956 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms