Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HAPLN3Q96S86 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HAPLN3Q96S86 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms