Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX18Q96RF0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX18Q96RF0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms