Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF145Q96MT1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms