Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC42Q96M95 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC42Q96M95 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC42Q96M95 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms