Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PGLYRP3Q96LB9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGLYRP3Q96LB9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGLYRP3Q96LB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms