Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK4Q96L34 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK4Q96L34 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms