Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNFT2Q96EX2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms