Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM19Q96E16 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM19Q96E16 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMIM19Q96E16 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms