Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRRFQ96E11 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms