Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC58Q96CX6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC58Q96CX6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC58Q96CX6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms