Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT35Q92764 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT35Q92764 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT35Q92764 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms