Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CASKIN1Q8WXD9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CASKIN1Q8WXD9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
CASKIN1Q8WXD9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CASKIN1Q8WXD9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms