Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR60Q8WVS4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR60Q8WVS4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR60Q8WVS4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms