Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMO3Q8TAP4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMO3Q8TAP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMO3Q8TAP4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMO3Q8TAP4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMO3Q8TAP4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMO3Q8TAP4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMO3Q8TAP4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO3Q8TAP4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO3Q8TAP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMO3Q8TAP4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms