Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM58Q8NG06 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms