Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNNM3Q8NE01 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM3Q8NE01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM3Q8NE01 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms